航海學院于1992年9月由原航海系(成立于1953年)、電子工程系(成立于1962年)和航政系(成立于1989年)合并而成。1998年4月原電子工程系并入信息工程學院。
航海學院設有航海技術和海事管理兩個專業。航海技術專業在國內外享有較高的知名度，是1953年并校時保留并進一步發展起來的重點專業，1992年被列為交通部"八五"首批重點建設學科專業。該專業支持交通信息工程和載運工具運用工程兩個學科，這兩個學科均具有博士和碩士學位授予權。目前，學院已形成博士、碩士、本科及成人教育等多層次、多方式的辦學體系。日校以培養碩士研究生和本科生為主，并招收本科、碩士留學生；成人教育則兼辦函授、夜大、國內外高級船員培訓班、高級海事管理人員培訓班，并為其他院校代培進修人員等。在校學生人數達2000余人。
航海學院師資力量雄厚，具有教授、副教授高級專業技術職稱的人員占教師總數一半以上。學院擁有6個教研室、4個實驗室。在129名教職工中有專任教師95人，其中教授10人、副教授40人、講師41人、實驗技術人員17人，專任教師中有22人持有符合國際船員培訓發證值班標準的船長證書或高級船長證書，21人持有大副證書。形成了以國內外航海界知名度高、影響大、學術造詣深的教授為帶頭人，以具有博士、碩士學位的中青年骨干教師為主力的多支學術梯隊，以具有博士、碩士學位的中青年骨干教師為主力的多支學術梯隊，并經常參與國內外學術交流，有的教師被聘為國際海事組織的專家顧問。
學院辦學條件優越，有能夠滿足各門專業課教學需要的實驗室，如導航、電航儀器、航海、氣象、航海模擬器、天象館等先進的實驗室，可供培養適應現代化船舶駕駛與管理的高級航海技術人才之用，也可供廣大教師、高年級本科生、研究生進行科學研究。各專業課程均設有專業教室，配有現代化教學設備和教學軟件。
學院有較強的科研能力，主要研究方向是：交通信息工程及控制系統、交通運輸安全保障與防護技術、載運工具運行安全理論與技術、載運工具運行環境分析與保護等。近年來承擔國家自然科學基金、交通部部屬單位及學校委托的項目，多項研究成果處于國內領先或達到國際先進水平，并獲得省部級科技進步獎，為我國航海科技水平的提高做出了重要貢獻。
航海學院除承擔本科生教學任務與科學研究工作外，還承擔世界海事大學大連分校的教學任務，并根據國際海事組織(IMO)的標準，為國內外培訓在職船長和駕駛員，以及進行適任證書評估、考試、培訓等。
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