目前發現的神龍翼龍科化石大部分保存不完整,所以古生物學家對于神龍翼龍科的生活方式存在很多爭議。一些古生物學家認為神龍翼龍科的生活方式類似現生的鸛類,在岸邊和陸地上一邊散步一邊捕食。
但是,一些古生物學家提出了不同觀點。俄羅斯科學院動物學研究所的A.O. Averianov最近觀察了烏茲別克斯坦上白堊統土倫階地層發現的神龍翼龍頸椎化石,并使用計算機重建了神龍翼龍的頸椎三維模型。
A.O. Averianov發現神龍翼龍科頸椎的相對比例為第一+第二<第三<第四<第五>第六> > 第七>第八>第九頸椎,和其他短頸椎的翼手龍亞目相同。但是,神龍翼龍科的中部第四到第六頸椎頸部長度增加。
以前大部分重建認為神龍翼龍科在站立的時候頸部筆直伸出,但是實際應該為S形彎曲,第四頸椎到第五頸椎、第五頸椎到第六頸椎之間的最大角度為20°,第八頸椎到第九頸椎之間的最大角度為17°。
A.O. Averianov認為神龍翼龍科的生活方式可能類似現生的鵜鶘,神龍翼龍科首先在大型內陸或近岸海洋水體上空飛行尋找獵物(可能主要是魚類),然后張開大嘴把獵物吞入喉囊。
A.O. Averianov還認為神龍翼龍科不太可能岸邊和陸地捕食,因為神龍翼龍科在陸地上是非常笨拙的動物,很容易受到捕食。
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