孛兒只斤愛猷識理答臘被封為太子之後，元朝內部黨爭日益激烈。愛猷識理答臘自己試圖奪取帝位，提前登基，這樣就造成了他和他父親的關系緊張。1364年，元至正24年，他的政敵將軍孛羅帖木兒帶兵闖入大都，孛兒只斤愛猷識理答臘被迫流亡到王保保的控制區太原，并以此為基地，召集各省軍閥準備反攻孛羅。與此同時，元順帝也對孛羅的專權產生不滿，遂派人將其刺死，將人頭送到太原，召回了愛猷識理答臘并與其和解。
1368年，元至正28年，明朝洪武元年，朱元璋的將軍徐達攻克了大都，從中國趕走了元朝的皇族。孛兒只斤愛猷識理答臘隨他的父親元順帝逃往上都，在1370年他的父親元惠宗在上都死去，他在和林繼承了皇位，并改元宣光。
北元在當時仍保持犟大的勢力，在1372年的戰事中對於明朝贏得了一個壓倒性勝利。
元昭宗於1378年逝世，他死後由弟天光帝脫古思帖木兒繼位。
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