菲律賓與中國華南隔海相望，自古就是華人移居的重要目的地。明初鄭和七下西洋后，中國聲威所及，菲律賓的呂宋、蘇祿等國都時斷時續地同明廷保持著朝貢貿易。到16世紀70年代，移居菲律賓的華人逐漸增多。當時明王朝部分開放海禁，剛殖民菲律賓的西班牙對商品和人員極為渴求。華僑的增多，令晚期明帝國與西班牙在菲律賓產生碰撞。

　　殖民者肆意屠殺旅菲華僑

　　1565年，西班牙殖民者入侵菲律賓，攻占宿務島，1571年侵占呂宋，建馬尼拉城。西班牙人對菲律賓統治初期，對前往菲律賓的華人采取拉攏政策，因為菲律賓當時的經貿發展要仰賴華人的努力和貿易。但隨著華人影響的提升，西班牙殖民者與華人的矛盾開始凸顯，并最終導致1603年的大屠殺。

　　1574年，活躍于福建一帶的私人武裝頭領林鳳差點攻占馬尼拉，讓西班牙殖民者對華人大為恐懼。1593年，菲律賓總督達斯馬里納斯遠征摩鹿加群島，由于他強迫華僑充當槳手，引發不滿。途中，達斯馬里納斯所在旗艦上的華僑潘和五等人奮起反抗，將船上包括總督在內的西班牙人幾乎盡數殺死(僅12名士兵死里逃生)，隨后駕船遠走。這次事件后，馬尼拉當局煽動排華浪潮。在這一背景下，1594年初，一支中國船隊在福建官員帶領下，載著士兵和武器到達馬尼拉，接回3000名華人。

　　1603年，菲律賓島又出現傳聞：中國皇帝有意占領菲律賓以獲取這里的黃金。傳聞源自一名在呂宋生活多年的木匠，他稱呂宋有一座機易山，“其上金豆自生”。萬歷皇帝信以為真，下令福建官員前去勘查。西班牙人本就對中國頗為忌憚，何況菲島華僑眾多，因此疑心中國想“開疆裂土”。隨著排華情緒漸濃，西菲當局欲迫害甚至屠殺華僑的意圖越來越明顯。

　　1603年10月3日，不愿坐以待斃的華僑爆發起義，但由于缺少武器和軍事經驗，他們僅堅持了41天。起義很快演變成一場大屠殺。在當局的煽動和蒙騙下，包括土著、日僑在內的各方力量都參與到屠殺中。據統計，至少2萬華僑被殺。

　　馬尼拉憂心明廷報復

　　大量屠殺華僑對菲律賓本土經濟產生致命影響，物資匱乏、經濟蕭條。當局財政狀況惡化，甚至需要借貸度日。
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