安徽鳳陽人。明神宗朱翊鈞第六子。生母李貴妃，與桂王朱常瀛同母。萬歷二十九年【1601】十一月受封惠王。在京師居數十年，直至天啟七年【1627】八月，崇禎帝即位后，才就藩到荊州府。在荊州十年，明末農民大起義爆發，張獻忠在湖廣四處征戰，威震一時，湖廣的明朝藩王或被殺，或逃亡。朱常潤也四處逃竄，先奔衡州，又奔紹興，居無定所。崇禎帝自殺后，江南部分士紳曾有立常潤為監國之意，但常潤卻非可立之人，常潤皈依釋教，整日禮佛參禪，不通人間事理，對朝政一無所知。正因為如此，常潤未能成為抗清領袖，也不可能成為。
清軍攻占江南后，進軍杭州，潞王朱常?降，不久，居臺州的崇王朱慈?也降清，居紹興的朱常潤也隨即降清。此時是順治二年【1645】秋季。常潤被攜入北京后，上奏清廷，感謝清廷“不殺”、“奉恩給養”，并極力闡述自己“自幼皈依佛教，不諳人事”，當然，目的就是為了茍活下去，繼續享受富貴榮華。但是清廷的并不因為朱常潤的搖尾乞憐而對他法外施恩，朱常潤的也依然擺脫不了被屠宰的命運，古語“覆巢之下焉有完卵”，明朝已經滅亡，明朝的皇族也不會存在。他們只有兩條路：死和逃亡。
順治三年【1646】春季，京師風傳南方抗清力量與京城內的明朝皇族相聯合，欲圖復辟。清廷隨即對投降的明朝王爺們的府邸進行搜查，結果真就搜出了金銀印信等“證據”。當然，此舉完全是清廷的把戲，朱常潤等人自降清的那一刻起，其活動已受到嚴密監視，這印信從何而來，不得而知。
總之，結局就是朱常潤等人在五月的一天被集體處決，地點就是今天北京的柴市口附近，和朱常潤一起被殺的還有朱常?、朱由崧【弘光帝】、朱由【木取】、朱紹?、朱慈?等十一人。
朱常潤卒年五十二歲，其葬處不明，其后代情況也未見記載。
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