馬融俊才善文，曾從京兆（今屬西安市）處士摯恂問學。漢安帝時，任校書郎，詣東觀（朝廷藏書處）典校秘書。因得罪當權的外戚鄧氏，滯于東觀，十年不得升官。直到鄧太后死后，才召拜郎中。漢桓帝時，外任南郡太守，因忤大將軍梁冀，遭誣陷，免官，髡徙朔方。后得赦，復拜議郎，重在東觀著述，以病辭官，居家教授。他達生任性，不太注重儒者節操，常坐高堂，施絳紗帳，前授生徒，后列女樂，開魏、晉清談家破棄禮教的風氣。其學生多達四百余人，升堂入室者有五十余人，其中鄭玄、盧植是佼佼者。 馬融博通今古文經籍，世稱“通儒”。長期在東觀校書著述，為他能綜合各家之學，遍注古文經典，提供了十分有利的條件。他善于吸取前人的學術研究成果，他曾想訓解《左氏春秋》，及見賈逵、鄭眾的著作，就說：“賈君精而不博，鄭君博而不精。既精即博，吾何加焉！”（《后漢書·馬融列傳》）他綜合了賈、鄭二家的優點，撰成《春秋三傳異同說》，是《春秋》學集大成的一部專著。馬融還與北地太守劉環討論過《春秋》學的一些分歧問題。據考證，馬融注《易》，源于《費氏易》，又雜采子夏之說以及孟氏、梁丘氏、京房氏諸家《易》學。注《尚書》，取鄭氏父子和賈逵之說。注《詩》，除《毛氏詩》外，兼采《韓詩》。此外，馬融注《三禮》、《孝經》、《論語》；甚至注《老子》、《淮南子》、《離騷》、《列女傳》（劉向撰）等。他還著賦、頌、碑、誄、書、記、表、奏、七言、琴歌、對策、遺令，凡二十一篇。 馬融之學，屬于古文經學中的一種典型。在儒家經學的發展史上，馬融開始了綜合各家、遍注群經這種帶有開創性的工作，他的經注成就，使古文經學開始達到成熟的境地，預示著漢代經學發展將步入新的時期。馬融的經學著作多已佚。清人馬國翰《玉函山房輯佚書》黃 《漢學堂叢書》有部分輯錄。
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