巴西轉基因作物的采用率逐漸增加，成為世界第二大使用這種技術的國家，僅次于美國。根據國際農業生物技術應用服務組織（ISAAA）的統計，/15年度巴西種植的大豆作物91.9％為轉基因品種，上兩個種植季則為87％。轉基因大豆采用率最高的地區是巴西南部，占比超過95％。在巴西北部較新的生產地區，約80％為轉基因大豆品種。

馬托格羅索州是巴西最大的大豆生產州，但只有85.9％的大豆作物為轉基因。基于傳統大豆市場所提供的額外收益，該州西部的農民大多仍種植常規的大豆品種（非轉基因）。對于這個區域的農民，保留常規的大豆的特性也更加容易，因為幾乎所有的大豆均從沿亞馬遜河的限制數量的港口進行出口。

/15年巴西種植的玉米作物中預計有88.8％為轉基因品種，/14和/13年度分別為86％和80％。中西部地區和巴西南部的農民更傾向于使用轉基因玉米雜交種，這一新技術作物的采用率略高于90％。巴西北部對這些品種的采用率滯后，僅約60％。

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